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Cheikh Talla 

Chercheur spécialisé en biostatistique et modélisation statistique

Chercheur scientifique, Unité d'épidémiologie, Institut Pasteur de Dakar, Sénégal.

 

 

Formation

  • 2003: Baccalauréat en Mathématiques et physique,  Lycée technique, Maurice DelaFosse
  • 2007: Maître II en Mathématiques appliquées, Université Gaston Berger, Saint Louis, Sénégal
  • 2008: DEA en Mathématiques appliquées, Université Gaston Berger, Saint Louis, Sénégal 
  • 2017: PhD en Statistiques appliquées, Université Gaston Berger, Saint Louis, Sénégal 
  • 2017: Postdoc en Biomathématiques, Institut Pasteur de Dakar, Sénégal

Parcours professionnel

Je suis un biostatisticien actuellement employé à l'Institut Pasteur de Dakar, au Sénégal, en tant que stagiaire postdoctoral. J'ai été initialement formé au Sénégal (Université Gaston Berger et Institut Pasteur de Dakar) où j'ai obtenu mon Master II et mon doctorat. Je m'intéresse aux méthodes statistiques et à la modélisation, à la modélisation linéaire mixte, aux modèles statistiques à base hiérarchique, aux méthodes bayésiennes et aux tests de diagnostic.

Parmi les nombreuses tâches liées à mon poste actuel à l'unité d'épidémiologie de l'Institut Pasteur, je suis chargé de gérer et de mettre en place une plateforme de système d'alerte précoce pour la détection en temps réel de tout événement anormal de type grippe, de maladies telles que la dengue, les arbovirus et la diarrhée à partir des sites sentinelles syndromiques en utilisant des seuils épidémiques et des séries chronologiques. L'expérience professionnelle que j'ai acquise en tant que statisticien m'a permis d'acquérir des bases solides en matière de méthodes épidémiologiques et statistiques, ainsi qu'un intérêt marqué pour la prise de décision.

Activités de Recherche

Mes premiers travaux portent sur la modélisation des méthodes statistiques. Au cours de mon doctorat effectué à l'unité d'entomologie de l'Institut Pasteur de Dakar, j'ai développé un cadre de modèle spatio-temporel utilisant un modèle linéaire généralisé mixte (GLMM) pour identifier les périodes et les zones à risque potentielles ainsi que les facteurs impliqués dans l'émergence du virus de la FVR à Barkedji, au Sénégal. Ces modèles prennent en compte la surdispersion trouvée dans les Abonnez-vous à DeepL Pro pour éditer ce document. Visitez www.DeepL.com/pro pour en savoir plus. données de comptage ainsi que les facteurs de confusion non observés en incluant des effets aléatoires spatialement structurés et non structurés. Les résultats de ce projet ont permis de disposer d'un outil supplémentaire dans le développement et l'amélioration d'un système de surveillance et de contrôle.

Dans le cadre de la surveillance permanente du paludisme dans les villages de Dielmo et Ndiop, coordonnée par les unités de l'Institut Pasteur en collaboration avec l'Institut de recherche et de développement, j'ai récemment collaboré avec le Dr Makhtar Niang, l'investigateur principal en parasitologie moléculaire.

Activités de Santé Publique

  • Depuis 2015 Maître de conférences en statistique : Master 2 Université Cheikh Anta Diop
  • 2016 : Aide (INDA Hands-on NGS-Statistics, session théorique et pratique 03-14 octobre, 2016 Mbour Sénégal)
  • Depuis 2015 : Chargé de cours en analyse de données avec le logiciel R à l'École supérieure polytechnique de Dakar (ESP) : Diplôme en ingénierie de la conception

Activités de formation

SUPERVISION DES ÉTUDIANTS (supervision du Maître)

  • 03/15 - 11/15 : Master 2 en santé publique pour Marion Dollat, CNAM / Pasteur, France
  • 04/17 -11/17 : Master 2 en santé publique pour Florent Arinal, CNAM / Pasteur, France
  • 2020 : Master 2 Institut Africain des Sciences Mathématiques/Mbour
  • 2020 : Master 2 Institut Africain des Sciences Mathématiques/Mbour
  • 2020 : Master 2 Institut Africain des Sciences Mathématiques/Mbour
  • 2021 : Master 1 Institut National des Sciences Appliquées (INSA)/ Toulouse

Publications majeures

  • Réunion de la FAO : Participation aux discussions avec les experts pour la "Réunion de coordination des parties prenantes du contrôle progressif de la fièvre de la vallée du Rift" 22 au 24 juillet 2014, Dakar (Sénégal)
  • Cheikh Talla, Diawo Diallo, Ibrahima Dia, Yamar Ba, Jacques-André Ndione Andy Morse, Aliou Diop, Mawlouth Diallo. Colloque du Réseau international de l'Institut Pasteur, Paris-France, 10-13 septembre 2014.Poster
  • Cheikh Talla, Diawo Diallo, Ibrahima Dia, Jacques-André Ndione, Mawlouth Diallo. Ecole d'été sur la modélisation des impacts climatiques pour les pays en développement : Eaux, agriculture et santé. (The Abdus Salam International Center for Theoretical Physics) Trieste-Italie Septembre 2011. Communication orale
  • Talla C, Diallo D, Dia I, Ba Y, Ndione JA, Morse A, Diop A, Diallo M. Modélisation des hotspots des deux vecteurs dominants de la fièvre de la vallée du Rift (Aedes vexans et Culex poicilipes) à Barkédji, Sénégal. (2016). Parasites & Vecteurs 9 : 111.
  • Ndiaye EH, Fall G, Gaye A, Bob NS, Talla C, Diagne CT, Diallo D, Ba Y, Dia I, Kohl A, Sall AA, Diallo M. Compétence vectorielle d'Aedes vexans (Meigen), Culex poicilipes (Theobald) et Cx. quinquefasciatus Say du Sénégal pour les lignées ouest et est africaines du virus de la fièvre de la vallée du Rift. (2016). Parasites & Vecteurs 9(1):94.
  • Talla C, Diallo D, Dia I, Ba Y, Ndione JA, Sall AA, Morse A, Diop A, Diallo M. Modélisation statistique de l'abondance des vecteurs de la fièvre de la vallée du Rift ouest-africaine à Barkédji, Sénégal. (2014). PLoS ONE 9(12).
  • Faye O, Ba Y, Faye O, Talla C, Diallo D, Chen R, Mondo M, Ba R, Macondo E, Siby T, Weaver SC, Diallo M, Sall AA. Épidémie urbaine d'infection par le virus de la dengue de sérotype 3, Sénégal, 2009. (2014). Maladies infectieuses émergentes 20(3), 456.
  • Ngom EHM, Faye ND, Talla C, Ndiaye EH, Ndione JA, Faye O, Ba Y, Diallo M, Dia I. Densités saisonnières d'Anopheles arabiensis et taux d'infection en relation avec les classes de paysage et les paramètres climatiques dans une zone sahélienne du Sénégal. (2014). BMC Infectious Diseases 2014, 14:711.
  • Diallo D, Talla C, Ba Y, Dia I, Sall AA, Diallo M. Distribution temporelle et configuration spatiale de l'abondance des vecteurs de la fièvre de la vallée du Rift et de la fièvre du Nil occidental à Barkedji, Sénégal. (2011). Journal of Vector Ecology, 36(2), 426-436.
  • Bei AK, Niang M, Deme AB, Daniels RF, Sarr FD, Sokhna C, Cheikh Talla, Faye J, Diagne N, Doucoure S, Mboup S, Wirth DF, Tall A, Ndiaye D, Hartl DL, Volkman SK, Toure-Balde A.(2018). Changements dramatiques dans la complexité génétique de la population du paludisme à Dielmo et Ndiop, Sénégal, révélés par la surveillance génomique. J Infect Dis. 30 janvier;217(4):622-627
  • Niang M, Thiam LG, Sane R, Diagne N, Cheikh Talla, Doucoure S, Faye J, Diop F, Badiane A, Diouf B, Camara D, Diene-Sarr F, Sokhna C, Richard V, Toure-Balde A. Substantial asymptomatic submicroscopic Plasmodium carriage during dry season in low transmission areas in Senegal : Implications pour le contrôle et l'élimination du paludisme. (2017). PLoS One 3 août;12(8).

 

  1. Taieb F, Mbaye KD, Tall B, Lakhe NA, Talla C, Thioub D, Ndoye AM, Ka D, Gaye A, Cissé Diallo VM, Dia N, Ba PS, Cissé M, Diop M, Diagne CT, Fortes L, Diop M, Fall NM, Sarr FD, Diatta M, Barry MA, Badiane AS, Seck A, Dubrous P, Faye O, Vigan-Womas I, Loucoubar C, Sall AA, Seydi M. Traitement par hydroxychloroquine et azithromycine des patients hospitalisés infectés par le SRAS-CoV-2 au Sénégal de mars à octobre 2020. J Clin Med. 2021 Jun 30;10(13):2954. doi:10.3390/jcm10132954. PMID : 34209237 ; PMCID : PMC8269162.
  2. Niang M, Sandfort M, Mbodj AF, Diouf B, Talla C, Faye J, Sane R, Thiam LG, Thiam A, Badiane A, ViganWomas I, Diagne N, Diene Sarr F, Mueller I, Sokhna C, White M, Toure-Balde A. Fine-scale spatiotemporal mapping of asymptomatic and clinical P. falciparum infections : epidemiological evidence for targeted malaria elimination interventions. Clin Infect Dis. 2021 Mar 2:ciab161. doi : 10.1093/cid/ciab161. Epub avant impression. PMID : 33677477.
  3. Gildas Boris H, Idrissa D, Marie Louise S, C Talla, Aliou BM, Fatoumata DS, Rebecca G, Raymond B, Diamilatou T, Vincent R, Oumar F, Abdoulaye S, Muriel V. Identification des agents pathogènes potentiellement associés à la fièvre non palustre chez les enfants : A Pilot Study in Peri-Urban Dakar, Senegal. Am J Trop Med Hyg. 2021 Feb 8;104(4):1335-41. doi : 10.4269/ajtmh.19-0963. Epub avant impression. PMID : 33556036 ; PMCID : PMC8045601.
  4. Barry MA, Arinal F, Talla C, Hedible BG, Sarr FD, Ba IO, Diop B, Dia N, Vray M. Performance of case definitions and clinical predictors for influenza surveillance among patients followed in a rural cohort in Senegal. BMC Infect Dis. 2021 Jan 7;21(1):31. doi : 10.1186/s12879-020-05724-x. PMID : 33413174 ; PMCID : PMC7790019.
  5. Talla C, Pierre-Audigier C., Alame-Emane, A. K., Audigier, B., Grall, N., Ruimy, R., ... & Armand-Lefevre, L. (2020). Tendances de la tuberculose dans une région hot-spot de Paris, France. The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease, 24(4), 428-435.
  6. Gaye A, Diagne MM, Ndiaye EH, Dior Ndione MH, Faye M, Talla C, Fall G, Ba Y, Diallo D, Dia I, Handschumacher P, Faye O, Sall AA, Diallo M. Vector competence of anthropophilic mosquitoes for a new mesonivirus in Senegal. Emerg Microbes Infect. 2020 Feb 28;9(1):496-504. doi : 10.1080/22221751.2020.1730710. PMID : 32106784 ; PMCID : PMC7054948
  7. Cheikh Talla, Dollat M, Sokhna C, Diene Sarr F, Trape JF, Richard V. Measuring malaria morbidity in an area of seasonal transmission : Seuils de parasitémie pyrogène basés sur une étude de suivi de 20 ans. PLoS One. 2019 Jun 27;14(6).
  8. Beye NF, Kane C, Ayessou N, Kebe CMF, Talla Cheikh, Diop CM, Sène A. Modélisation de la cinétique de déshydratation de quatre variétés d'oignons dans un four et une serre solaire. Héliyon. 2019 Sep 14;5(9)
  9. Makhtar N., Talla C, Nafissatou D, Fatoutama D.S, Cheikh S. La cartographie spatio-temporelle Po 8419 des infections palustres asymptomatiques et cliniques révèle des foyers de transmission du paludisme pour des interventions de contrôle ciblées. BMJ Global Health 2019;4 : A35.
  10. Matheus S, Talla C, Labeau B, de Laval F, Briolant S, Berthelot L, Vray M, Rousset D. Performance of 2 Commercial Serologic Tests for Diagnosing Zika Virus Infection. Emerg Infect Dis. 2019 Jun;25(6):1153- 1160.
  11. Beye, N., Ayessou, N., Kane, C., Mbaye, M., Talla C., Sene, A., & Diop, C. Étude de la cinétique de séchage de quatre variétés d'oignons dans un four et une serre solaire. J. Food Res. (2019), 8(3), p59.
  12. Gaye A, Wang E, Vasilakis N, Guzman H, Diallo D, Cheikh Talla, Ba Y, Dia I, Weaver SC, Diallo M. Potentiel des moustiques Aedes sylvatiques et urbains du Sénégal pour transmettre les nouveaux sérotypes émergents de la dengue 1, 3 et 4 en Afrique de l'Ouest, PLoS Negl Trop Dis. 2019 Feb 13;13(2) : e0007043, 2019 Feb.
  13. Niang MN, Barry MA, Cheikh Talla, Mbengue A, Sarr FD, Ba IO, Hedible BG, Ndoye B, Vray M, Dia N ; 4S Network Group. Estimation du poids des visites de syndromes grippaux associés à la grippe sur le total des visites cliniques par le système de surveillance sentinelle de la grippe au Sénégal pendant les saisons grippales 2013-2015. Epidemiol Infect (2018) Dec ;146(16):2049-2055.
  14. Beye, N. F., Kane, C., Ayessou, N. C., Cheikh Talla., Sene, A., & Diop, C. M. Influence de la variété et du niveau de maturité sur le séchage naturel par chaleur convective de quatre variétés d'oignons cultivées au Sénégal. Sciences de l'alimentation et de la nutrition, (2018). 9(08), 997.
  15. Bei AK, Niang M, Deme AB, Daniels RF, Sarr FD, Sokhna C, Cheikh Talla, Faye J, Diagne N, Doucoure S, Mboup S, Wirth DF, Tall A, Ndiaye D, Hartl DL, Volkman SK, Toure-Balde A. (2018). Changements dramatiques dans la complexité génétique de la population du paludisme à Dielmo et Ndiop, Sénégal, révélés par la surveillance génomique. J Infect Dis. Jan 30 ;(2017) (4):622-627
  16. Niang M, Thiam LG, Sane R, Diagne N, Cheikh Talla, Doucoure S, Faye J, Diop F, Badiane A, Diouf B, Camara D, Diene-Sarr F, Sokhna C, Richard V, Toure-Balde A. Substantial asymptomatic submicroscopic Plasmodium carriage during dry season in low transmission areas in Senegal : Implications pour le contrôle et l'élimination du paludisme. (2017). PLoS One 3 août;12(8).
  17. Cheikh Talla, Diawo Diallo, Ibrahima Dia, Yamar Ba, Jacques-André Ndione Andy Morse, Aliou Diop, Mawlouth Diallo. Modélisation des hotspots des deux vecteurs dominants de la fièvre de la vallée du Rift (Aedes vexans et Culex poicilipes) à Barkédji, Sénégal. (2016). Parasites & Vecteurs 9 : 111.
  18. El Hadji Ndiaye, Gamou Fall, Alioune Gaye, Ndeye Sakha Bob, Cheikh Talla, Cheikh Tidiane Diagne, Diawo Diallo, Yamar Ba, Ibrahima Dia, Alain Kohl, Amadou Alpha Sall, Mawlouth Diallo. Compétence vectorielle d'Aedes vexans (Meigen), Culex poicilipes (Theobald) et Cx. quinquefasciatus Say du Sénégal pour les lignées ouest et est africaines du virus de la fièvre de la vallée du Rift. (2016). Parasites &Vecteurs 9(1):94.
  19. Cheikh Talla, Diawo Diallo, Ibrahima Dia, Yamar Ba, Jacques-André Ndione, Amadou Alpha Sall, Andy Morse, Aliou Diop, Mawlouth Diallo. Modélisation statistique de l'abondance des vecteurs de la fièvre de la vallée du Rift ouest-africaine à Barkédji, Sénégal. (2014). PLoS One 9(12).
  20. Ousmane Faye, Yamar Ba, Oumar Faye, Cheikh Talla, Diawo Diallo, Rubing Chen, , Mireille Mondo, Rouguiétou Ba, , Rouguiétou Ba, Edgard Macondo, Tidiane Siby, D, Scott C. Weaver, Mawlouth Diallo, Amadou Alpha Sall. Épidémie urbaine d'infection par le virus de la dengue de sérotype 3, Sénégal, 2009. (2014). Maladies infectieuses émergentes 20(3), 456.
  21. El Hadji Malick Ngom, Ndèye Diango Faye, Cheikh Talla, El Hadji Ndiaye, Jacques-André Ndione, Ousmane Faye, Yamar Ba, Mawlouth Diallo, Ibrahima Dia. Densités saisonnières d'Anopheles arabiensis et taux d'infection en fonction des classes de paysage et des paramètres climatiques dans une zone sahélienne du Sénégal. (2014). BMC Infectious Diseases (2014), 14:711.
  22. Diawo Diallo, Cheikh Talla, Yamar Ba, Ibrahima Dia, Amadou Alpha Sall, et Mawlouth Diallo. Distribution temporelle et schéma spatial de l'abondance des vecteurs de la fièvre de la vallée du Rift et de la fièvre du Nil occidental à Barkedji, Sénégal. (2011). Journal of Vector Ecology, 36(2), 426-436.

 

 

 

Talla Cheikh

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