Le département de recherche Epidémiologie moléculaire et la résistance aux antibiotiques des bactéries entériques de l'Institut Pasteur de Dakar travaille à suivre l’évolution des résistances de souches entériques face aux antibiotiques. Pour cela sont menées des études sur les mécanismes moléculaires de la résistance et de son transfert aux antibiotiques des souches de bactéries entéropathogènes. 

Les bactéries possèdent différents supports génétiques très élaborés permettant le transfert horizontal des gènes de résistance aux antibiotiques entre bactéries d’espèces ou de genres différents. Lors de ce transfert, les gènes sont véhiculés par des plasmides, des transposons, des intégrons ou des îlots génomiques.